Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/10348/9391
Title: Survey of Nasal Mycobiota in humans and pets – an epidemiological approach
Authors: Ferreira, Rodolfo José Pires
Advisor: Matos, Maria Manuela Do Outeiro Correia De
Coelho, Ana Cláudia Correia
Keywords: Public health
molecular biology
airborne fungi
nasal mucous membrane
Issue Date: 17-May-2019
Abstract: The fungi are eukaryotic organisms and they are the main beings responsible for the decomposition of organic matter, however, some display pathogenic properties on both humans and other animals. The airborne fungi have the capacity to disseminate through air and they may colonize the nasal mucous membrane, since it reunites favorable conditions to their development, such as temperature and moist. Fungi identification may be performed through routine microbiologic techniques, complemented with molecular biology techniques, increasing the accuracy of the identification. The aim of this study was the identification and characterization of fungi isolated from the nasal mucous membrane of humans and pets, in a way to establish a relation. In a total of 59 samples, 46 from humans and 13 from dogs, it was verified the occurrence of clinical relevant molds and there were isolated 380 fungi. In human samples, there was fungal growth in 84.8%, with the most occurring genera as Penicillium spp. (87.0%) and Cladosporium spp. (73.9%). Besides the most prevalent, there were also isolated Alternaria spp. (19.6%), Aspergillus spp. (10.9%), Fusarium spp. (10.9%), Mucor spp. (8.7%), Trichoderma spp. (2.2%) and Talaromyces marneffei (13.0%) and yeasts, such as Candida spp. (52.2%) and Rhodotorula spp. (32.6%). The fungal growth was lower in individuals with any allergy or with any respiratory tract disease, these results were statistically significant for Cladosporium spp. (p=0.0014 e p= 0.001, respectively). In dog samples, 76.9% demonstrated fungal growth and the most prevalent genera were Cladosporium spp. (61.5%) and Penicillium spp. (46.1%).In dog samples, 76.9% demonstrated fungal growth and the most prevalent genera were Cladosporium spp. (61.5%) and Penicillium spp. (46.1%). The DNA was extracted from 5 isolates of Aspergillus spp., 8 from Cladosporium spp. and 7 from Penicillium spp. with an outgroup of 2 isolates of Talaromyces marneffei. The genetic variability analysis through ISSR markers revealed a high polymorphism of about 89.6% with the amplification of 132 unique bands. The T. marneffei isolates were identified through Nested-PCR and confirmed by DNA sequencing. Concluding, the molecular genetics techniques are a great complementary tool to microbiology techniques, because they are able to identify and characterize fungi that wouldn’t be distinguishable otherwise
Os fungos são organismos eucariotas e são os principais decompositores de matéria orgânica, no entanto, alguns demonstram propriedades patogénicas tanto para humanos como para animais. Os fungos anemófilos têm a capacidade de se disseminar pelo ar e podem colonizar a mucosa nasal, uma vez que esta reúne condições favoráveis ao seu desenvolvimento, como temperatura e humidade. A identificação de fungos pode ser realizada através de técnicas rotineiras de microbiologia, complementadas com técnicas de biologia molecular, desta forma aumentando a exatidão da identificação. O objetivo deste trabalho foi a identificação e caracterização de fungos provenientes da mucosa nasal de humanos e animais domésticos, de forma a tentar estabelecer uma relação. Nas 59 amostras obtidas, 46 de humanos e 13 de cães, verificou-se a ocorrência de fungos filamentosos com importância clínica, sendo isolados 380 fungos no total. Nas amostras humanas, verificou-se crescimento fúngico em 84.8%, com maior ocorrência de Penicillium spp. (87.0%) e Cladosporium spp. (73.9%). Para além dos géneros mais prevalentes, também foram isolados Alternaria spp. (19.6%), Aspergillus spp. (10.9%), Fusarium spp. (10.9%), Mucor spp. (8.7%), Trichoderma spp. (2.2%) e Talaromyces marneffei (13.0%) e leveduras, como Candida spp. (52.2%) e Rhodotorula spp. (32.6%). O crescimento fúngico foi menor em indivíduos com qualquer tipo de alergia ou de doença respiratória, estes resultados foram significativos para Cladosporium spp. (p=0,0014 e p= 0,001, respetivamente). Nas amostras de cães, 76.9% apresentaram crescimento fúngico e os géneros mais prevalentes foram Cladosporium spp. (61.5%) e Penicillium spp. (46.1%). Foi extraído DNA de 5 isolados de Aspergillus spp., 8 de Cladosporium spp. e 7 de Penicillium spp. com um outgroup composto por 2 isolados de Talaromyces marneffei. A análise de variabilidade genética através de marcadores ISSR revelou um polimorfismo elevado, aproximadamente89,6%, com a amplificação de 132 bandas únicas. Os isolados de T. marneffei foram identificados por Nested-PCR e confirmados através de sequenciação de DNA. Conclui-se que as técnicas de genética molecular são um ótimo complemento às técnicas de microbiologia, permitindo a identificação e caracterização de fungos que de outra forma não seriam distinguíveis.
Description: Dissertação de Mestrado em Biotecnologia para as Ciências da Saúde
URI: http://hdl.handle.net/10348/9391
Document Type: Master Thesis
Appears in Collections:DGB - Dissertações de Mestrado
TD - Dissertações de Mestrado

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